細說清朝 · 一〇七 節制四省
三天以後，鮑超再勝李秀成於撫州，解了撫州之圍。李秀成無心戀戰，向浙江的方面撤軍。鮑超追他，追到貴溪之東的雙港，又勝；最後，在二十三日，追到上饒西南鉛山，大勝。
清廷在九月間發生政變。輔政的大臣載垣、端華、肅順先後被捕；慈安太后鈕祜祿氏與慈禧太后葉赫那拉氏「兩宮垂簾聽政」；咸豐的同母弟恭親王奕訡被封為「議政王，在軍機處行走」。
於恭親王的大力支持之下，曾國藩在十月間被「兩宮皇太后」授權「統轄江蘇、安徽、江西三省並浙江全省軍務，節制提督巡撫以下各官」。同時，左宗棠也被授權「赴浙江剿賊，調遣提鎮以下官」。
浙江這時候，大部分已為太平軍所占。侍王李世賢在江西被左宗棠擊敗後入浙，於十一年四月攻下常山，江山，開始圍攻衢州；五月攻下壽昌、金華、龍游、湯溪、嚴州（建德）、武義；六月攻下遂昌，松陽、永康。到了九月，李秀成在江西被鮑超擊敗入浙，又把浙東浙西許多縣份一一占領，只剩下衢州、溫州、湖州、杭州。杭州終於在十一月二十九日被攻破，巡撫王有齡自殺。
清廷在十二月二十日任命左宗棠為浙江巡撫；十天以後，加授曾國藩為「協辦大學士」。
曾國藩定下戰略：先取安徽中部，次取浙江。安徽中部的戰事，分作江北，江南兩路。江北由曾國荃負責，以無為州、運漕鎮、巢縣、含山、和州為進兵路線。江南由鮑超負責，以池州（貴池）、銅陵、荻港、魯港、蕪湖、太平府（當塗）、采石磯，為進兵路線。
江北一路的北邊，有太平軍的重鎮廬州及其守將陳玉成。江南一路的南邊，有太平軍的重鎮寧國府（宣城）及其守將楊輔清。這兩人均不是容易對付的。兩人以外，守池州的劉官方，守青陽的古隆賢，守廣德的童容海，都很夠瞧。
關於浙江，儘管清廷再三對他催促，曾國藩倒並不十分著急。曾國藩認為，必須鮑超先把皖南肅清，然後才能夠分兵由皖南的廣德與徽州，兩路入浙，幫助左宗棠的由上饒玉山入浙的一路。而且，左宗棠的兵太少，必須等候蔣益澧的一支湘軍由廣西調來，才有採取攻勢的可能。
清廷同時也催他派兵加強鎮江的防務，催他派兵去救上海，打蘇常二州，又要他派兵由揚州之東的所謂「里下河」一帶（泰興、靖江、如皋、南通），「拊江南之背」，渡過長江，襲取常熟、無錫，等地。
曾國藩指揮若定，頗有「將在外，君命有所不受」的氣魄，不慌不忙，按照自己的計劃，一步一步地去做。
曾國藩原已於打下安慶以後，派楊載福率領水師，會同兩營陸軍，取得長江南岸的池州與銅陵；又派了曾國荃指揮長江以北的陸軍六千人於九月間攻克長江以北的無為州、運漕鎮、東關。
曾國荃到達東關以後，奉命停止前進，分兵駐守所克城邑；其後，被派回湖南，增募鄉勇。
這一年的冬天，捻黨首領李昭壽在滁州受欽差大臣勝保招安，改名李世忠。李世忠於冬夏之交，替清朝攻下天長、六合、浦口、江浦，與駐防揚州的都興阿、駐防鎮江的馮子材連成一氣。
清廷希望曾國藩直搗南京，曾國藩卻並無動作，靜候（一）鮑超一軍在長江南岸的進展；（二）曾國荃把新募的鄉勇訓練好，帶來安徽。
同治元年（1862年）三月，鮑超大勝古隆賢於池州之正東，及銅陵之東南的青陽，殺了一萬三千多人，占領青陽。
曾貞干（國葆）於五天以後占領銅陵東北的繁昌，十五天以後占領繁昌東南的南陵。水師在三月二十七日占領繁昌東北的魯港。
四月十五日，陳玉成的廬州被多隆阿攻破。陳玉成去壽州，投奔苗沛霖，被苗沛霖出賣，捆送勝保的軍營，其後於押解赴京的途中被凌遲處死。
廬州之破，給曾國藩增加不少勇氣。恰好，曾國荃及其新募之勇已於二月中旬來到，換出駐守各地的舊勇，大舉東進。在三月二十日占領巢縣、含山，二十二日占領和州。
其後，配合了黃翼升的若干水師，曾國荃越過蕪湖，於四月二十日占領太平府（當塗），五月一日占領南京正南的秣陵關。
曾貞干於是也在四月二十二進占蕪湖，二十八日占領南京西南的板橋。
鮑超在六月十五日戰勝楊輔清於寧國（宣城），加以占領；二十一日至二十八日，連克石埭、太平縣、涇縣。在此期間，他又接受童容海的投降，不戰而獲廣德。童容海是石達開舊部，本不姓童，姓洪，這時候恢復原姓。他的部隊有六萬人之多。曾國藩只准他留下三千，其餘一律遣散。（結果，在八月底鬧了一個亂子，有兩萬人出走，投奔楊輔清；餘下的四萬人內訌，洪容海丟掉廣德，帶一萬多人去寧國，投奔鮑超。鮑超仍舊依照曾國藩的前令，只准他留三千人，編為五營，其餘一律遣散。）
李秀成從蘇州趕回南京，把曾國荃的大營包圍了起來。從閏八月二十日開始，一共圍了四十六天。
曾國荃守得很好，李秀成撤圍而去，卻派了洪春元去安徽，奪回含山、東關、巢縣。
曾國藩寫信給曾國荃，說他孤軍深入，本極冒險，切不可屯兵堅城之下，蹈向榮與和春的覆轍，不妨藉著追擊洪春元為名，派少數人去追，帶多數人撤退到蕪湖附近的金柱關，與水師保持聯絡。然後，轉兵東向，由高淳、溧陽、以攻宜興，叫鮑超從寧國（宣城）出發，由建平（郎溪）、廣德，以攻長興，同時分撥若干水師，駛入內河、小湖，三路並進，打到太湖邊為止。
曾國荃不肯聽從大哥的話。這一位「九弟」個性甚強，從不服輸。他認為既已扎在南京近郊的雨花台，固守了四十六天未破，決無撤退之理。
鮑超那一邊，確也並無力量對太平軍採取攻勢，怎能夠由寧國府府城（宣城）而建平，而廣德，而長興？而且，寧國府府城之南的寧國縣，已於九月初六日失守。
來攻的太平軍首領是古隆賢。此人的任務是進入江西。他在十月十九日打旌德，失敗。轉而向西，打太平縣，於十一月初三加以占領。再轉而南，穿過黟縣所屬的西埭鎮，於初七占領祁門。三天以後，左宗棠所派的援兵開到，將他逐走。
他因此無法繼續南進，轉而向北，占領石埭縣。休息了一些時候，轉而向西。於十二月初五攻占青陽。
青陽的西邊是池州，池州的西南是安慶。曾國藩這時候坐鎮在安慶，慌忙調了重兵來一面防守池州，一面力爭青陽，才在十二月二十五日把青陽奪了回來，化險為夷。
曾國藩能夠奪回青陽，卻不能夠奪回石埭與太平兩縣。古隆賢一直占著這兩縣，成為曾國藩的心腹之患。極會打仗的鮑超，雖則駐紮在寧國府（宣城）的高祖山，也對古隆賢無可奈何。
鮑超本人得了病。他軍中的官兵，以及曾國荃雨花台大營的官兵，也多半得了病。什麼病呢？是一種瘟疫，其起因是屍首泡在河裡江里的太多，飲水之中充滿有害的細菌。
同治二年正月二十八日，曾國藩離開安慶，巡視池州、蕪湖以及南京雨花台的防務，於二月二十八日返抵安慶。