清代官書記明台灣鄭氏亡事 · 卷三
康熙二十年（一六八一）二月辛卯（初七日），命展沿海邊界。
總督姚啟聖、巡撫吳興祚先後具疏請開邊界，俾沿海人民復業。上命議政王貝勒大臣集議。議政王等奏言：前經大將軍康親王等奏請，已令展界。嗣因海寇竊據海澄，復遷邊界，移居民於內地。今金、廈雖復，賊渠未滅，事關重要，應令福建總督、巡撫、提督定議奏聞。上諭：金門、廈門諸處已設官兵防守，應如該督、撫所題，照舊展界。如有奸民藉此通賊者，仍令嚴行察緝。
六月戊子（初七日），命總督姚啟聖等規定彭湖、台灣。
啟聖等奏：偵得逆賊鄭錦已於正月二十七日身死，其長子為眾所殺，偽侍衛馮錫范立錦次子克塽，錫范婿也。上諭：鄭錦既伏冥誅，賊中必乘離擾亂，宜乘機規定彭湖、台灣。總督姚啟聖、巡撫吳興祚、提督諾邁、萬正色等其與將軍喇哈達、侍郎吳努春同心合志，分派綠旗舟師酌量前進，務期剿撫並用，底定海疆，毋誤事機。
七月己卯（二十八日），命原任右都督施琅為福建水師提督，帥舟師進取彭湖、台灣。
上諭議政王等曰：今諸路逆賊俱已殲除，應以見在舟師破滅海賊。原任右都督施琅系海上投誠，且曾任福建水師提督，熟悉彼處地利、海寇情形，可仍以右都督充福建水師提督總兵官，加太子少保，前往福建。到日即與將軍、總督、巡撫、提督商酌，剋期領舟師進取彭湖、台灣。其萬正色改為陸路提督，諾邁還京候補。
朱逖先先生曰：施琅之初任福建水師提督，由於海澄公黃梧之薦（見逆臣傳中鄭芝龍傳）。此次復任福建水師提督，則由於姚啟聖之薦。此事他書均未載，惟海上見聞錄卷二云：『總督姚上疏請攻台灣，力薦內大臣施琅可任水師提督。萬提督（正色）言台灣難攻，且不必攻。朝命召見施琅，仍以靖海將軍充水師提督，改萬正色為陸師提督』。見聞錄所記，頗多確實可信。
姚啟聖之薦施琅，其奏疏今存於姚氏憂畏軒奏疏卷三。第一奏疏略云：『題為特舉能臣蚤靖海氛事：目下剿賊平海，全賴水師提督一官。今陸路既不能衝擊矣，如水師戰勝，賊自敗走台灣；如水師不勝，賊仍盤踞廈門。是總督、巡撫、陸路提督不過相助為理，而決勝成功，實水師提督一人任也。前自昭武將軍請辭水師提督之後，會推鎮江將軍王□，今改任四川提督，升授湖廣總兵萬（正色）為福建水師提督；是皇上求賢若渴之心，求一勝任水師提督者，亦可謂博覽旁求、費盡苦心矣。提督與臣，均系封疆大臣，自應和衷共濟，豈可濫置異同之詞。臣思今日在外諸臣，且不必問其才幹之有能與不能，要先看其遇事之肯任與不肯任；亦不必問其行事之克濟與不克濟，要先看其心力之肯盡與不肯盡，而大概定矣。臣任藩司時，聞知原任水師施琅威名，鄭錦畏之如虎，所以鄭錦將施琅之子齊舍與侄亥舍給以官爵以羈縻之。通省之鄉紳、舉貢生員、文武兵民、黃童白叟，萬口同聲，皆知其堪任水師提督也。臣任藩司時，統領韓大任標兵、並臣自繕兵救援漳州，即以為海賊異常猖獗，水師提督亟須得人，保舉施琅，具啟康親王，並通詳寧海將軍喇、鎮平將軍耿、刑部尚書介、禮部侍郎吳、總督郎、巡撫楊在案。後聞施有子有侄在海，且當日撤回原自有因，臣亦不敢力保。臣同平南將軍商議云：施琅即有一子在海，尚有六子在京，其京中家口數百，豈肯為一子而舍六個兒子與數百口家眷乎！今水師提督愈選愈難，北風將至，大舉及期，若再所調船隻不多，攻擊不勝，轉盼又是一年，糜費數百萬錢糧，縱賊養廱，遺累百姓，臣罪竟無底止矣。此時斷難緘默，伏乞皇上蚤賜定奪。謹具疏密題。康熙十八年六月』。
第二薦疏略云：『保舉原任水師提督施琅，如蒙皇上俞允，祈即命施琅馳驛星赴江南，面驗鳥船。江、浙之船，果否堪令閩省官兵統帶至閩？並令兼程赴閩，酌議現在船隻是否足用？彼以曾破廈門之官，輕車熟路，一言可決，實勝臣等揣摹憶度之詞萬萬矣。如以水師提督已補萬（正色），查調任水師提督王以定海將軍管提督事，則施琅曾受國恩授靖海將軍或命施琅以將軍總統水師事務，則將軍、提督可並收得人之效矣。至廣東應否添立水師、萬正色可否移調廣東，仰祈皇上睿裁。臣會同巡撫臣吳（興祚）、將軍管提督事臣楊（捷）合疏密題，伏祈敕議施行。康熙十八年七月』。
據上二疏，則排除萬正色為福建水師提督而力薦施琅為福建水師提督，全出於姚啟聖之密奏。此書抑姚揚施，姚之薦施沒而不載，似施琅受清聖祖特達之知，而下文施琅貪功攬權之劣跡，乃可以掩飾而不露矣。
八月戊子（初八日），調浙江平陽總兵官朱天貴赴福建。
總督姚啟聖奏：臣軍前所有舟師，乃平陽總兵官朱天貴舊部；若令他人統轄，恐一時未能馴習。且天貴聲名素為海寇所憚，來歸之時已與賊相攻成仇；今若令將原軍，必能竭力圖報。請敕下浙江總督，速發天貴並原帶部下精兵三百人至福建，同臣等協力進剿。上報可。
十月丙午（二十七日），命總督姚啟聖同提督施琅帥師進剿。
琅奏：督、撫均有封疆重寄。今姚啟聖、吳興祚俱決意進兵，臣職領水師，征剿事宜理當獨任。但二臣詞意懇切，非臣所能禁止，且未奉有督、撫同進之旨，相應奏聞，恭請睿裁。上諭：總督姚啟聖統轄福建全省兵馬，同提督施琅進取彭湖、台灣；巡撫吳興祚有刑名錢榖諸務，不必進剿。
十二月辛巳（初二日），命加從征台灣各官秩。
先是，上允總督姚啟聖奏，於部例外另立賞格罰例，以激勸將士。至是，啟聖請加進剿官員級，兵部議不准行。上諭：見在蕩平海寇，進取台灣官員可各加一級。
康熙二十一年（一六八二）四月甲午（十七日），命總督姚啟聖等審度海寇情形，酌行剿撫。
先是，提督施琅奏：賊■〈舟宗〉久泊彭湖，悉力固守。當此冬春之際，颶風時發，我舟驟難過洋。臣見在練習水師，又遣間諜通臣舊時部曲，使為內應。請俟明年三、四月間進兵，可獲全勝。上允之。至是，琅又奏：夏至南風盛發，不可進兵，請至十月大舉。上命議政王貝勒大臣集議。議政王等奏言：師期不便屢遷，應檄姚啟聖、施琅剋期於夏至後進取台灣。上諭：進剿海寇，關係重大，總督姚啟聖、提督施琅身在地方，務將海上形勢、賊中情狀審察確實，如有必可破剿機宜，即協謀合慮，酌行剿撫，毋失事會。
五月戊辰（二十一日），命福建將帥諸臣防守陸路隘口。
上諭議政王等曰：據報，總督姚啟聖、提督施琅於五月初四日帥師進取台灣。大兵啟行之後，金門、廈門及陸路諸隘口所關甚要，速移文福建將軍、巡撫、陸路提督、總兵官等，務期有裨地方，協志和衷，嚴加防禦，以固守要隘。
乙亥（二十八日），命總督姚啟聖等相機進剿。
安塘筆帖式報稱：大兵進取台灣，以風大不得前，總督姚啟聖尚駐銅山、提督施琅移泊雲霄。聞海賊劉國軒等扼守彭湖諸隘，瞷我兵前進，即抄襲其後。於是議政王等會議，請檄總督姚啟聖、提督施琅，若目前風大，未便進剿，即統官兵回汛，整飭舟師，相機再舉。上報可。
八月壬寅（二十七日），命撤還福建滿兵。
總督姚啟聖奏：閩省有綠旗官兵，又有漢軍甲兵，進取台灣、防守地方，業已足用，且機會難定，糜餉實多，大兵似宜撤回。上命將軍喇哈達等盡率福建大兵還京師。十月己卯（初六日），命總督姚啟聖等催辦糧餉。
提督施琅奏：臣於水師營中簡選精兵二萬餘人、戰船三百艘，已足破滅海寇，請令督、撫趣辦糧餉給臣軍，而獨任臣以討賊，無拘時日。臣整理舟師，時加操練，但遇風利，即可進兵。上諭：提督施琅既請以討寇自任，總督姚啟聖可停其進剿，同巡撫吳興祚趣辦糧餉，勿致稽誤。前姚啟聖具題功罪定例，付施琅遵行。
朱逖先先生曰：案施琅貪功攬權，冒險徼幸，於姚啟聖憂畏軒奏疏卷四夾擊台灣疏中披露無餘。其疏云：『准水師提督臣施（琅）移到密題疏稿，內稱台灣進剿方殷，督、撫二臣各有封疆之寄，內地責任匪輕；今二臣矢志決行，辭極意切，非臣所能中止，且未奉有督、撫同征之旨等語。臣閱之，不禁中心如焚如溺，而不能自已也。臣與撫臣吳（興祚）均蒙皇上特拔隆恩，同心合力，誓以死報。今進剿台灣，何等重大，臣等焉肯捨生怕死，一聽提臣自為決戰，而不竭力相助有成乎！臣等見得欲取台灣，勢必先取澎瑚。然止靠此一路進兵，風浪順逆利鈍，尚未可知。密探台灣幅■〈巾員〉，上至上淡水，離福州之定海僅四更天船；下至下淡水，離廣東之南澳僅九更天船：此台灣之袤延長闊如此也。內多土番，半歸海賊。但自上淡水至台灣，計程二十餘日，崇山險惡，溪港七十餘條。自正月至九月，雨水泛漲，勢難進兵。惟此十月、十一月、十二月，天晴水涸，可以計進。臣等若攻克上淡水，則恩撫土番，結陣而進。如能直抵台灣，則澎湖進兵，易於取勝；即不能，而中途遙應，深入賊後，亦可以寒賊之膽而壯我兵之威。臣捐造修戰艦七十隻，捐募勇兵三千二百名，撫臣亦竭力捐造捐募。然上淡水一路，必須先進二十餘日。臣欲同撫臣先進兵淡水，安布已定，而後飛棹圍頭，復與提臣進兵。此臣等四月聞鄭經死時，即造船、募兵、措餉、置械，直至今日矣。今如提臣所請，不幾置此兵於可惜乎！且水師提臣冀挑選四鎮官兵，所用水兵止一萬一千餘名，所用陸兵實有二萬餘名，水兵自服提臣調度，若不出海，則陸兵無人總統，萬一臨期退縮，不大誤此盛舉乎？即提臣水陸官兵盡皆勇奮，船隻戰守悉已諳熟，臣身任總督猶不敢坐視；況提臣到任未幾，水陸配船未定，臣安肯逍遙緩帶，一聽提臣之自為戰乎？提臣所請為內地計者，常時之舊規，臣等請出兵夾擊者，出奇之勝策。即臣等出師海上，自將內地安頓妥當而後行，亦不敢冒昧從事也。如過此冬月後，即不能再攻淡水，然二臣各統捐兵助戰，或合攻以壯軍聲、或分途以亂賊心，亦未必於提臣無小補也』。
觀姚氏此疏，其作戰計劃，主於夾擊；苟不為獨占功勳計，未有不贊成其雙方並進之策而得其聲援者。乃施琅進先入之言，謂『督臣姚啟聖生長北方，汪洋巨浪之中恐非所長。撫臣吳興祚見在升任，即有新撫臣，初到視事，恐未識閩疆情形』（見靖海紀事卷上施琅密陳航剿海務機宜疏）。又云：『督臣滅賊之念實切，惜乎生長北方，水性海務非其所長，登舟之際，混心吐嘔，身體維艱；願獨任臣討賊。所設水師，就中挑選精兵二萬有奇、大小戰船三百號，盡堪破賊，可以無用陸師，轉覺牽制，卒難成功』（見靖海紀事卷上施琅請決計進剿以收實效疏）。於是清廷獨任施琅進攻彭湖、台灣。而不知琅實行險徼幸，並非計出萬全。
如以六月進攻彭湖：彭湖於六月內數起大風，無三日晴朗。遇大風，舟立壤（見海上見聞錄卷二）。劉國軒謂『施琅徒有虛名。當此日日颶暴之朝，敢統舟師越海征船』。又云：『俗言六月，三十日有三十六暴。今日乃十六、明日十七，十八、九就是觀音暴、洗蒸籠暴，安有無風之理？當養精畜銳拒險守隘，以觀其敗』（見台灣外紀卷二十七）。當大戰時，雲起蔽天，鄭師相賀，以海洋占「雷鳴風止，雲起風生」，可乘機也。俄大雷電，眾駭而潰。國軒推案哭曰：『天也，夫何言』！遂突吼門去（見倪在田續明紀事本末卷七）。然始交綏時，琅目中炮傷，幾殆。其徼幸一也。
琅破彭湖後，乘勝迫台灣，至鹿耳門，膠淺不得入，泊海中十有二日，忽大霧，潮高丈余，舟浮而過。台灣人亦驚為天意（見明延平忠節王始末卷四）。其徼幸二也。
劉國軒敗回台灣，鄭克塽大會文武，議戰守之策。建威中鎮黃良驥曰：『彭湖失守，台灣勢危，不如將大小戰船暨洋船配眷口兵士，從此山邊直下，取呂宋為基業』。時馮錫范執政，亦主全師取呂宋。中書舍人鄭德瀟進呈地圖，並陳可取事宜甚詳（見台灣外紀卷二十九）。而劉國軒先受姚啟聖密書之招，國軒以書報之，啟聖故泄之，以離間其上下（見明延平節王始末卷四）。於是國軒懼克塽之疑己，決主降清而排斥取呂宋之謀，施琅遂得安取台灣，受鄭氏之降。其徼幸三也。